Rodolfo Gamaliel Avila Bonilla

Genética y Biología Molecular

Investigador Cinvestav 2C

Laboratorio 19 Genómica y Biología Molecular de ARNs
5557473800  5322
rodolfo.avilab@cinvestav.mx

Líneas de investigación

Nuestra principal línea de investigación se enfoca en el estudio de las interacciones entre ARN y proteínas, con especial atención a cómo las modificaciones postranscripcionales del ARN pueden influir en el establecimiento de estas interacciones, especialmente por parte de las proteínas del sistema inmunológico innato. Este sistema desempeña un papel crucial como la primera línea de defensa del organismo contra agentes infecciosos virales, así como en la regulación de células tumorales y el proceso de senescencia celular. Para llevar a cabo nuestra investigación, empleamos una combinación de técnicas bioinformáticas y experimentales basadas en biología molecular. Este enfoque nos permite analizar de manera integral las interacciones entre ARN y proteínas, con el objetivo de comprender mejor los mecanismos subyacentes y su impacto en la función del sistema inmunológico innato.

Proyectos relevantes

Mecanismos Moleculares de Discriminación entre ARNs propios (endógenos) y no propios (exógenos) por parte del sistema inmunológico
Implicación Transcripcional de los ARN No Codificantes (ncRNAs) y su Influencia en la Inmunidad Innata
Efecto de las Proteínas de Unión a ARN (RBPs) en la Inmunidad Innata

Semblanza

El Dr. Ávila ha desempeñado funciones como Investigador Postdoctoral Asociado en el Institute of Immunology and Infection de la Universidad de Edimburgo, Escocia, Reino Unido, así como Investigador Postdoctoral en el Instituto Politécnico Nacional (IPN) en México. Obtuvo su Doctorado en Ciencias en Biotecnología y una Maestría en Ciencias en Biomedicina Molecular por el IPN, ambos con la máxima distinción académica, "Cum Laude". En la actualidad, ocupa el cargo de titular del laboratorio de Genómica y Biología Molecular del ARN en el Departamento de Genética y Biología Molecular del Cinvestav, ubicado en la Ciudad de México. Su investigación se centra en la comprensión de los mecanismos de discriminación entre los ácidos ribonucleicos propios y no propios, destacando su interés en la biología de los ARN y su influencia en la activación del sistema inmunológico innato.
 

Publicaciones recientes y/o relevantes

• Avila-Bonilla, R. G., & Macias, S. (2024). The molecular language of RNA 5' ends: guardians of RNA identity and immunity. RNA,  rna.079942.124. https://doi.org/10.1261/rna.079942.124
   
• Avila-Bonilla, R. G., Velazquez-Guzman, J. A., Reyes-Zepeda, E. I., Gutierrez-Avila, J. L., Reyes-López, C. A., Cisneros-Sarabia, A., Saavedra, E., Lopéz-Sandoval, A., Ramírez-Moreno, E., López-Camarillo, C., & Marchat, L. A. (2023). Comparative genomics and interactomics of polyadenylation factors for the prediction of new parasite targets: Entamoeba histolytica as a working model. Bioscience reports, 43(2), BSR20221911. https://doi.org/10.1042/BSR20221911
   
• Ávila-Ramírez, M. L., Reyes-Reyes, A. L., Avila-Bonilla, R. G., Salas-Benito, M., Cerecedo, D., Ramírez-Moreno, M. E., Villagrán-Herrera, M. E., Mercado-Curiel, R. F., & Salas-Benito, J. S. (2023). Differential Gene Expression Pattern of Importin β3 and NS5 in C6/36 Cells Acutely and Persistently Infected with Dengue Virus 2. Pathogens (Basel, Switzerland), 12(2), 191. https://doi.org/10.3390/pathogens12020191
   
• Avila-Bonilla, R. G., & Salas-Benito, J. S. (2022). Interactions of host miRNAs in the flavivirus 3´UTR genome: From bioinformatics predictions to practical approaches. Frontiers in cellular and infection microbiology, 12, 976843. https://doi.org/10.3389/fcimb.2022.976843
   
• Avila-Bonilla, R. G., López-Sandoval, Á., Soto-Sánchez, J., Marchat, L. A., Rivera, G., Medina-Contreras, O., & Ramírez-Moreno, E. (2022). Proteomic and Functional Analysis of the Effects of Quinoxaline Derivatives on Entamoeba histolytica. Frontiers in cellular and infection microbiology, 12, 887647. https://doi.org/10.3389/fcimb.2022.887647
   
• Salgado-Martínez, A. I., Avila-Bonilla, R. G., Ramírez-Moreno, E., Castañón-Sánchez, C. A., López-Camarillo, C., & Marchat, L. A. (2021). Unraveling the relevance of the polyadenylation factor EhCFIm25 in Entamoeba histolytica through proteomic analysis. FEBS open bio, 11(10), 2819–2835. https://doi.org/10.1002/2211-5463.13287
   
• Avila-Bonilla, R. G., Yocupicio-Monroy, M., Marchat, L. A., Pérez-Ishiwara, D. G., Cerecedo-Mercado, D. A., Del Ángel, R. M., & Salas-Benito, J. S. (2020). miR-927 has pro-viral effects during acute and persistent infection with dengue virus type 2 in C6/36 mosquito cells. The Journal of general virology, 101(8), 825–839. https://doi.org/10.1099/jgv.0.001441
   
• Avila-Bonilla, R. G., Yocupicio-Monroy, M., Marchat, L. A., De Nova-Ocampo, M. A., Del Ángel, R. M., & Salas-Benito, J. S. (2017). Analysis of the miRNA profile in C6/36 cells persistently infected with dengue virus type 2. Virus research, 232, 139–151. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2017.03.005