Jesús Bernardino Velázquez Fernández

Biotecnología y Bioingeniería

Investigador por México Conahcyt

Laboratorio 53 Interacciones Metabolismo-Ambiente

jesusb.velazquez@cinvestav.mx

5557473800 Ext. 3319

Semblanza:

Maestría y Doctorado por el Departamento de Bioquímica del Cinvestav - Zacatenco. Con estancias posdoctorales en el Centro de Cáncer Massey en la Universidad de la Mancomunidad de Virginia (Richmond, EEUU), en el Laboratorio interdisciplinario de aguas continentales de la Universidad de Lorena (Nancy, Francia) y el Laboratorio de canales iónicos de la Unidad de Biofísica de la Universidad del País Vasco (Bilbao, España). Productividad científica: 45 artículos científicos, 4 capítulos de libro internacionales y 1 libro internacional. Proyectos financiados 6. Ha formado 14 estudiantes de licenciatura, cuatro de maestría y dos de doctorado como director de tesis. Productividad científica: 45 artículos científicos, 4 capítulos de libro internacionales y 1 libro internacional. Proyectos financiados en México 6. Con dominio de técnicas analíticas cromatográficas, espectroscópicas y moleculares, así como de análisis informáticos y estadísticos multivariados, incluyendo modelados matemáticos y herramientas de machine-learning. Inglés, francés y español leídos y hablados fluidamente. Latín leído fluidamente y hablado al 70%. ORCID: 10.1186/s12866-024-03437-8. Se trabaja con fuertes bases fisicoquímicas, bioquímicas, matemáticas y metodológicas lo que permite el trabajo multidisciplinario y una formación científica adecuada para los estudiantes de posgrado.

Líneas de investigación:

Relación metabolismo - ambiente, con especial énfasis en los mecanismos de resiliencia de los organismos de todos los niveles taxonómicos ante contaminantes. Estos pueden ser utilizados como bioindicadores o biomarcadores para monitoreo ambiental, así como para el desarrollo de tecnologías de remediación. A su vez, dentro de los cambios observados en humano pueden ser usados como biomarcadores de exposición, efecto, susceptibilidad ante tóxicos y para progreso de enfermedades derivadas. Todo ello desde el punto de vista bioquímica, molecular, genómico, proteómico y metabolómico. En la actualidad, trabajamos con contaminantes emergentes (antibióticos y otros fármacos, plaguicidas y plásticos, entre otros), los posibles mecanismos de degradación y de resistencia microbiana, así como los biomarcadores de exposición, efecto o susceptibilidad en humano.

Proyectos relevantes:

• Estudio de la comunidad microbiana (y patogenicidad) de plantas de tratamiento de aguas residuales y su interrelación con los contaminantes emergentes.
• Variación del proteoma de Mycobacterium provocado por cambios en condiciones de cultivo o mutaciones.
• Efectos de los plaguicidas en las comunidades bacterianas del suelo.
• Dinámica y diversidad microbiana en micro y nanopartículas en el aire de zonas urbanas.
• Genómica y proteómica de organismos relevantes en las tradiciones mexicanas.

Publicaciones recientes y/o relevantes:

• Jesús Bernardino Velázquez-Fernández, Claudia Elizabeth Aceves Suriano, Frédèric Thalasso, Nina Montoya-Ciriaco, and Luc Dendooven. Structural and functional bacterial biodiversity in a copper, zinc and nickel amended bioreactor:  shotgun metagenomic study. BMC Microbiology. https://doi.org/10.1186/s12866-024-03437-8.
• L. Arellano-García, M. Mendiola-Chávez, J.B. Velázquez-Fernández. Nitrification of an anaerobic filter effluent in a flat sheet membrane aerated biofilm reactor. Biochemical Engineering Journal 201 (2024) 109121. https://doi.org/10.1016/j.bej.2023.109121.
• B. Estela Valdez-Guzmán, Jesús Bernardino Velázquez-Fernández, and Luis A. Arellano-García. Bioprocessing of reduced sulfur compounds enhanced by treatedwastewater with an alkaliphilic sulfur-oxidizing microbial consortium. Bioremediation Journal. https://doi.org/10.1080/10889868.2024.2407240
• Iván Salgado, Ernesto Prado Montes de Oca, Alejandro Pereira-Santana, Isaac Chairez, Luis Figueroa-Yáñez, Andrés Rivera Chávez, Jesús Bernardino Velázquez-Fernández, Teresa Alvarado Parra and Adriana Vallejo. Deep Learning Techniques to Characterize the RPS28P7 Pseudogene and the Metazoa-SRP Gene as Drug Potential Targets in Pancreatic Cancer Patients. Biomedicines 2024, 12(2), 395; https://doi.org/10.3390/biomedicines12020395.
• Mario Alberto Flores-Valdez, César Pedroza-Roldán, Jesús Bernardino Velázquez-Fernández, Michel de Jesús Aceves-Sánchez, Abel Gutiérrez-Ortega, Wendy López-Romero, Jeannette Barba-León, Jacobo Rodríguez-Campos. Proteome and immunogenicity differences in BCG Pasteur ATCC 35734 and its derivative, the vaccine candidate BCGΔBCG1419c during planktonic growth in 7H9 and Proskauer Beck media. Tuberculosis 144 (2024) 102432. https://doi.org/10.1016/j.tube.2023.102432.
• Enrique Salgado-Hernández, Alejandro Alvarado-Lassman, Sergio Martínez Hernández, Jesús B. Velázquez-Fernández, Ana E. Dorantes-Acosta, Erik S. Rosas-Mendoza, and Ángel I. Ortiz-Ceballos. Energy-Saving Pretreatments Affect Pelagic Sargassum Composition and DNA Metabarcoding Analysis Reveals the Microbial Community Involved in Methane Yield. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2023.03.21.533673.
• Jesús Bernardino Velázquez-Fernández, Gustavo Henrique Martins Ferreira-Souza, Jacobo Rodríguez-Campos, Michel de Jesús Aceves-Sánchez, Jorge Bravo-Madrigal, Alba Adriana Vallejo-Cardona and Mario Alberto Flores-Valdez. Proteomic characterization of a second-generation version of the BCG BCG1419c vaccine candidate by means of electrospray-ionization quadrupole time-of-flight mass spectrometry. Pathog Dis. 2021 Jan 16;79(1). doi: 10.1093/femspd/ftaa070.
• Ibarra-Rodríguez, Diana and Contreras-Ramos, Silvia Maribel and Arellano-García, Luis Alberto and Rodríguez-Campos, Jacobo and Velazquez-Fernandez, Jesús Bernardino, Multiresidue Method to Simultaneously Determine Emerging Contaminants in Water by Spe-Uplc-Ms/Ms. Available at SSRN: https://ssrn.com/abstract=4481629 or http://dx.doi.org/10.2139/ssrn.4481629